Как iNaturalist подсчитывает число таксонов?

Изменено Вт, 3 Сен на 6:09 PM

ОГЛАВЛЕНИЕ


«Таксон» — это узел дерева жизни. Рассмотрим упрощенную ветвь дерева со следующими 7-ю таксонами семейства Саламандровые класса Амфибии. 


Теперь предположим, что мы опубликовали 9 наблюдений, и они были идентифицированы таким образом, что 4 наблюдения были идентифицированы как род Nothophthalmus, 2 наблюдения были идентифицированы как семейство Salamandridae, 2 наблюдения были идентифицированы как Taricha granulosa ssp. granulosa, и одно наблюдение идентифицировано как Taricha torosa



Сколько таксонов представлено в наблюдениях


Когда вы входите в iNaturalist, нажмите на "Ваши наблюдения" в заголовке, это приведёт вас на страницу Поиск.



На вкладке "Наблюдения" отображается количество наблюдений (например, 9), а на вкладке "Виды" - количество таксонов, представленных этими наблюдениями (например, 3). Но как именно ведёт здесь подсчёт iNaturalist?


Подсчёт листьев


Стандартный способ, которым iNaturalist подсчитывает таксоны, представленные в этих наблюдениях, называется "подсчет листьев". Подсчет листьев позволяет избежать двойного учета (например, подсчета как семейства Salamandridae, так и дочернего рода Notophthalmus) путем подсчета количества отдельных листьев таксономического дерева. Единственное предостережение заключается в том, что он объединяет подвиды (а также другие "внутривидовые" разновидности) с их родительскими видами, так что наблюдаемые подвиды всегда включаются в состав подсчёта.


Чтобы подсчитать количество листьев, iNaturalist сначала подсчитывает подвиды. Например, два приведенных выше наблюдения Taricha granulosa ssp. granulosa будут засчитаны как два наблюдения Taricha granulosa. Затем все наблюдаемые таксоны, которые являются предками других наблюдаемых таксонов в наборе, удаляются. Например, семейство Саламандровые является предком таксонов рода Восточноамериканские Тритоны, и поэтому игнорируется. 


Это означает, что окончательный подсчет составляет 3 таксона: род Восточноамериканский Тритон представлен 4 наблюдениями, Желтобрюхий тритон представлен 2 наблюдениями и Калифорнийский Тритон представлен одним наблюдением. 


Преимущество подсчета листьев состоит в том, что в него включаются отдельные таксоны, которые наблюдались, но не были идентифицированы как виды (например, род Восточноамериканский Тритон), и это позволяет избежать двойного учета (например, семейства Саламандровые и вида Калифорнийский Тритон). Недостатком подсчёта листьев является то, что объяснение алгоритма его подсчета является сложным, а сам подсчёт - дорогостоящим.


Вы можете заметить, что вкладка в ваших наблюдениях помечена как "Виды", хотя правильнее было бы озаглавить её "Таксоны", поскольку при подсчете могут учитываться не только видовые ранги, а, например, род Восточноамериканский Тритон. Иногда мы используем термин "виды", а не "таксоны", поскольку этот термин более привычен новичкам.


Обратите внимание, что рядом с меню фильтров в ваших наблюдениях стоит цифра "2". 


Это связано с тем, что "Ваши наблюдения" идентичны странице "Поиск", за исключением двух изменений в фильтрах "Поиск" по умолчанию. В опции меню "Поиск", отличие от опции меню "Ваши наблюдения", установлен фильтр "Ваши наблюдения" и отображаются только ваши наблюдения. Аналогично, хотя на странице "Поиск" по умолчанию проверяются "Проверяемые" наблюдения (т.е. "Поиск" и "Требуется идентификация", но не "Случайные" наблюдения), а в "Ваших наблюдениях" флажок "Проверяемые" снят, и, таким образом,в подсчет включаются случайные наблюдения. 


Предположим, что установлены флажки при поиске: "Требуется идентификация" (NI), "Исследовательский уровень" (RG) и "Обыкновенные наблюдения" (CA). Отметка "Проверяемое" проигнорировала бы Taricha torosa, поскольку этот таксон представлен только обычными наблюдениями. 




Подсчет числа видов


Когда мы отображаем таблицы лидеров по нескольким показателям одновременно (например, на вкладке Наблюдатели в меню "Поиск" или меню "Проекты"), вычислить количество листов для каждого из них слишком сложно с точки зрения вычислений. 


Таким образом, iNaturalist отображает "подсчет видов", который включает в себя объединение подвидов, и только потом происходит подсчет именно видов. В этом примере количество видов будет равно 2 




Если вы предпочитаете использовать количество видов, а не количество листьев, на вкладке "Виды" в "Поиске" воспользуйтесь элементом управления "Ранг" в меню "Фильтры" и установите более высокое значение ранга "Виды"



Статья помогла?

Отлично!

Спасибо за ваш отзыв

Извините, что не удалось помочь!

Спасибо за ваш отзыв

Расскажите, как мы можем улучшить эту статью!

Выберите хотя бы одну причину
Требуется проверка CAPTCHA.

Комментарий отправлен

Мы ценим вашу помощь и постараемся исправить статью